東山區位於臺灣臺南市東北方，北臨白河區，東鄰嘉義縣大埔鄉，西鄰新營區、後壁區，南接柳營區、六甲區、楠西區，土地總面積約有125平方公里。區內平原、丘陵、山地各佔約三分之一，急水溪水系集水區涵蓋全區九成以上面積。氣候上屬熱帶季風氣候，產業上則以農業為主。地理地形東山區位於平原與山地交會地帶，西半部為嘉南平原的一部分，東半部為丘陵及山地，除東南部一隅及東端烏山嶺以東地區外，其餘均屬於急水溪流域。市道175號以東大致為山區，屬於阿里山山脈之西烏山嶺支脈，山脊線海拔約700至900公尺之間，其主稜線在大凍山以北，形成嘉義大埔鄉與白河區、東山區的主要邊界。其最高點位於李仔園與嘉義縣大埔鄉交界的大獅嶺（又稱李仔園山），標高971公尺；市道175號至國道3號之間為中部丘陵地帶，海拔約100至300公尺之間；國道3號以西則為平原地帶。大凍山(又稱：大棟山)為台南市第一高峰，標高1241公尺，西側有露頭岩層，自南二高遠望，山形頗為壯闊，深受登山界人士之重視，因而列名台灣小百岳之一。望天湖山兩側並無高峰，自曾文水庫向北眺望，山勢頗為雄偉。水文區內主要河川有屬於急水溪水系的急水溪、六重溪、龜重溪，以及曾文溪水系的曾文溪及柚仔坑溪。急水溪為台南市北部的大型河川，源頭位於嘉義縣中埔鄉與大埔鄉交界處的凍子頂。流經台南市白河區，於青葉橋滙集六重溪後，成為本區西北部與白河區、後壁區、新營區的界河，續流至本區西端與龜重溪匯集後，始離開區境而去。最終於北門區注入台灣海峽。