為宣導自然保育觀念及讓遊客認識阿里山自然生態，林務局嘉義林管處利用舊阿里山工作站及其他舊建物重新規劃整建成阿里山生態教育館、一葉蘭館及山椒魚館。        行政院農業委員會林務局針對具特色之自然保護區域，配合其周邊腹地與森林景觀及資源條件，設置生態教育館，秉持著「宣導生態資訊、落實保育行動」的宗旨，作為大眾認識臺灣自然環境及保護（留）區相關資訊的窗口，以及落實在地保育工作的行動平台。


       生態教育館的主要功能分別為學習場域、保育資訊、研究監測及培力據點，透過提供生態環境及周邊保護（留）區的展示、解說與教育成為保育新知的學習場域；並且能夠成為推廣保育政策，落實保育工作的地區窗口；另為瞭解保護區現況，延伸出的定期保育監測工作，可成為地區性保育研究及環境監測成果的公眾平台；最後希望生態教育館能達到社區保育教育及研究監測人才培育的學習據點。目前林務局現有及籌劃中之各生態教育館包含紅樹林生態教育館、南澳生態教育館、員山生態教育館、拉拉山生態教育館、火炎山生態教育館、二水臺灣獼猴生態教育館、大武山生態教育館、瑞穗生態教育館、東勢全國保育教育中心、甲仙化石生態教育館以及阿里山生態教育館等等。


       基於上述理念，林務局嘉義林管處於阿里山國家森林遊樂區內運用舊有「舊阿里山工作站及造林工作站」的空間，分年規劃，逐步成立阿里山生態教育館，包含「臺灣一葉蘭生態故事館」以及「阿里山山椒魚館」等二處場域，向大眾介紹阿里山地區的保育工作。


       而阿里山生態教育館主要建築物於民國62年（1973）11月建造完成，早期為阿里山工作站辦公室，後來作為員工宿舍。生態教育館後方二棟日式木造建築原為舊造林工作站，自民國95年（2006）整修完成，並於民國101年（2012）起規劃為阿里山生態教育館範圍，亦即「臺灣一葉蘭生態故事館」以及「阿里山山椒魚館」，結合生態保育及鄰近保護區之資訊，提供生態及保育觀念的展示。