Der Bahnhof Niebüll  wurde 1887 erbaut und ist der größte Bahnhof der Stadt Niebüll. Er wird von der Deutschen Bahn heute in der Bahnhofskategorie 3 geführt und besitzt eine zweisprachige Beschilderung .BedeutungDer Bahnhof ist Eisenbahnknoten. Er verbindet die Marschbahn Westerland–Hamburg mit der neg-Strecke nach Dagebüll, die neben dem ÖPNV nach Föhr und Amrum starkem Urlauberverkehr, auch mit Kurswagen dient. Darüber hinaus wird vom Bahnhof Niebüll seit 2001 wieder die durch einen privaten Anbieter reaktivierte grenzüberschreitende Marschbahnstrecke in das dänische Tondern befahren. Die Strecke wird heute durch die Norddeutsche Eisenbahngesellschaft Niebüll (neg) bedient.Die Autoverladung für den Autozug nach Sylt im Süden des Niebüller Bahnhofs ist eine bedeutende Einnahmequelle der Deutschen Bahn.Bis zum Fahrplanwechsel 1981 fuhren von Niebüll Züge in der Relation Niebüll–Flensburg. Seitdem wird die Strecke ab Lindholm nur noch sporadisch genutzt; es gibt jedoch Bestrebungen für eine Wiederaufnahme des Personen- und Gütertransports auf dieser Ost-West-Trasse.BetriebEin großer Teil der Zugverbindungen wird mittlerweile von der Nord-Ostsee-Bahn betrieben, die zur Veolia-Gruppe gehört. Der Verkehr auf der Bahnstrecke Niebüll–Dagebüll wird von der Norddeutsche Eisenbahngesellschaft mbH (neg) betrieben. Daneben halten einige InterCity-Züge der Deutschen Bahn in Niebüll, um Kurswagen von und nach Dagebüll mit der neg auszutauschen und den Anschluss von Hamburg nach Sylt und in das westliche Dänemark zu gewährleisten.